Tantangan utama dalam menerapkan praktik terbaik Prompt Engineering meliputi prompt yang ambigu, kurangnya konteks, bias dalam model, kebutuhan akan format yang tepat, serta kurangnya evaluasi dan iterasi. Untuk mengatasi tantangan ini, penting untuk menggunakan bahasa yang jelas dan spesifik, memberikan konteks yang cukup, secara teliti mengevaluasi dan memperbaiki hasil untuk meminimalkan bias, menyediakan petunjuk format yang jelas, serta melakukan iterasi secara konsisten untuk menyempurnakan kualitas prompt. Dengan menangani tantangan ini, Prompt Engineering dapat menghasilkan output yang lebih relevan dan berkualitas tinggi.