C. Peranan Badan Golgi

       Kompartemen cis menyortir dan melepaskan protein RE serta menambahkan phosfat pada terminal gula dari protein lisosom. Kompartemen medial (bagian tengah sisterna) adalah tempat dimana N-acetyglucosamine ditambahkan. Penambahan galaktosa terminal dan asam N-acetylneuraminik terjadi dalam kompartemen trans dan juga di mana berbagai protein akan diurutkan berdasarkan tujuan akhir.

        Badan Golgi berperan dalam banyak proses selular yang berbeda tetapi yang utama adalah dalam hal sekresi. Badan Golgi menerima produk sel tertentu dari RE dan membawa produk ini ke dalam vesikula sekretori yang akan meneruskan lintasannya menuju ke bagian luar membran plasma sel, dan berdiffusi dengan membran. Bagian ini dapat terbuka untuk membebaskan isi vesikula keluar. Proses ini disebut eksositosis.

     Protein dari lumen RE akan diangkut kedaerah cis badan golgi oleh vesikula pengangkut. Kemudian akan terjadi pemindahan protein dari daerah sis ke daerah trans badan golgi. Di daerah trans ini protein-protein tersebut akan dipilah-pilah dan dikemas untuk disempurnakan sehingga siap di ekskresikan. Kemudian setiap macam protein ditunaskan dalam bentuk vesikuli sekretoris untuk ditimbun samapai ada isyarat untuk disekresikan. Jika ada isyaratnya maka senyawa yang terkandung dalam vesikula sekretoris akan dikeluarkan ke lingkungan ekstrasel. 

       Ketika terjadi sitokinesis pada pembelahan sel tumbuhan akan terbentuk matriks, di matriks tersebut banyak terdapat vesikel-vesikel yang berisi bahan baku dinding sel yaitu pectin, selulosa, hemiselulosa, dan sebagainya yang berasal dari badan Golgi. Matriks dan senyawa tersebut akan melebur dan membentuk sekat di antara dua buah inti di daerah mikrotubulus kutub untuk membentuk di dinding sel primer. Dinding sel primer akan terus disuplai dengan bahan pembentuk dinding sel yang dikemas dalam vesikuli untuk selanjutnya tumbuh menjadi dinding sel sekunder. 

     Kompleks golgi selain berperan dalam sekresi, juga memainkan peranan dalam persiapan protein-protein untuk organel-organel seperti lisosom dan membran plasma . Protein -protein yang dipersiapkan untuk lisosom atau membran plasma disintesis oleh ribosom-ribosom yang melekat pada retikulum endoplasma kasar. Beberapa dari protein-protein tersebut dilepaskan ke dalam lumen retikulum endoplasma dan yang lain tetap pada membran retikulum endoplasma dan kelak menjadi dinding vesikula transpor. Dalam beberapa menit setelah sintesis, protein-protein tersebut tampak pada permukaan cis dari badan golgi. 

     Badan Golgi berperan dalam pembentukan akrosom yaitu tudung pada spermatozoon. Tudung Akrosom ini berasal dari fusi dari vesikel badan golgi. Fungsi dari tudung akrosom adalah melisiskan membran sel telur (ovum) pada saat fertilisasi. Karena berisi enzim hidrolitik Hialuronidase.